Akademik kariyerine 1987’de Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyoistatistik Anabilim Dalı’nda araştırma görevlisi olarak başlayan Prof. Dr. İlker Etikan, Türkiye’de bu alanda kurulan ilk birimde görev alarak sağlık bilimlerinde disiplinlerarası etkileşimi temel alan çalışmalar yürüttü. 2003 yılında Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde Biyoistatistik Anabilim Dalı’nın kurucuları arasında yer aldı ve burada farklı idari görevler üstlendi.
2011-2014 yılları arasında Yakın Doğu Üniversitesi’nde yarı zamanlı olarak görev yaptıktan sonra, 2014’te tam zamanlı öğretim üyesi olarak üniversiteye katıldı. 1 Eylül 2014’ten itibaren Yakın Doğu Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyoistatistik Anabilim Dalı Başkanlığı görevini sürdüren Prof. Dr. Etikan, aynı zamanda birçok kurumsal kurul ve komisyonda aktif olarak görev almaya devam ediyor. Sağlık bilimlerinde yürüttüğü özgün araştırmalar, bilimsel yayınları ve ulusal-uluslararası iş birlikleriyle bilime ve topluma önemli katkılar sunan Prof. Dr. Etikan, her isme yaşam boyu bir kez verilen Dr. Suat Günsel Onur Ödülü Altın Madalyası’na hak kazanan dördüncü isim oldu.